ซานฟรานซิสโก หรือ เทศบาลซานฟรานซิสโก (เซบัวโน: Lungsod sa San Francisco, ตากาลอก: Bayan ng San Francisco) เป็นเทศบาลระดับขั้นที่ 3 ในจังหวัดเซบู ประเทศฟิลิปปินส์ จากการสำมะโนประชากรในปี พ.ศ. 2558 ประชากรในเทศบาลมีทั้งหมด 55,180 คนเป็นหนึ่งในเทศบาลที่ตั้งอยู่บนเกาะคาโมเตสซานฟรานซิสโกประกอบไปด้วยทางทิศเหนือเป็นจังหวัดเลย์เต บนทะเลคาโมเตส ทางทิศตะวันตกเป็นพื้นที่ทางทะเลของเทศบาลแคทมัน ทางทิศตะวันออกเป็นเกาะโปโล ซึ่งมีเมืองโปโลอยู่ภายในเกาะ ส่วนทางทิศใต้เป็นทะเลคาโมเตส